Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms