Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SphkapQ6NSW3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms