Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdcd11Q6NS46 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcd11Q6NS46 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms