Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep78Q6IRU7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms