Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk13Q69ZA1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms