Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Papd5Q68ED3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Papd5Q68ED3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms