Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrp4eQ66X19 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp4eQ66X19 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms