Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CilpQ66K08 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms