Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc8eQ66JT1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms