Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp9Q64HY3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp9Q64HY3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sp9Q64HY3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp9Q64HY3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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