Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim24Q64127 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms