Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a5Q63ZW6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms