Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Znf260Q62513 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Znf260Q62513 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Znf260Q62513 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Znf260Q62513 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Znf260Q62513 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Znf260Q62513 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Znf260Q62513 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Znf260Q62513 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Znf260Q62513 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Znf260Q62513 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms