Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sp4Q62445 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms