Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf6Q62311 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms