Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms