Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SnrpaQ62189 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms