Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhocQ62159 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms