Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms