Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms