Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
AcanQ61282 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AcanQ61282 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AcanQ61282 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AcanQ61282 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms