Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TmpoQ61033 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms