Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Klf3Q60980 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms