Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms