Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Laptm4aQ60961 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Laptm4aQ60961 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms