Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grik1Q60934 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms