Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms