Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CttnQ60598 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms