Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp13a3Q5XF89 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms