Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms