Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myh1Q5SX40 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myh1Q5SX40 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms