Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms