Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms