Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf215Q5SPX3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf215Q5SPX3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms