Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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