Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarf1Q5ND28 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms