Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms