Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms