Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3kQ5GIG6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms