Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nlrc3Q5DU56 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Nlrc3Q5DU56 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nlrc3Q5DU56 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nlrc3Q5DU56 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nlrc3Q5DU56 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nlrc3Q5DU56 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nlrc3Q5DU56 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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