Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms