Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnma5Q5DTT8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnma5Q5DTT8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms