Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms