Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrig2Q52KR2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrig2Q52KR2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms