Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spire1Q52KF3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms