Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC17

Adamts18, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts18Q4VC17 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Adamts18Q4VC17 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Adamts18Q4VC17 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Adamts18Q4VC17 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Adamts18Q4VC17 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Adamts18Q4VC17 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms