Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms