Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Snx25Q3ZT31 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx25Q3ZT31 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Snx25Q3ZT31 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Snx25Q3ZT31 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Snx25Q3ZT31 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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