Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc27Q3V036 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc27Q3V036 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms