Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrfip1Q3UZ39 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms